En Cipolletti se cuenta en la actualidad con un servicio de desagüe cloacal, que consta de la red de colectoras, colectores máximos, estaciones elevadoras, cañería de impulsión y la planta de tratamiento, que se encuentra ubicada a aproximadamente 2.000 m de la Av. de Circunvalación J. D. Perón.
La planta de tratamiento está integrada por una laguna primaria de alta carga, seguida por lagunas aireadas en serie, la primera del tipo anaeróbica, la segunda aireada de mezcla completa, y la tercera facultativa o de afinamiento.
El proceso de tratamiento biológico en la primera laguna aireada de alta carga es fundamentalmente anaeróbico, es decir que la estabilización de la materia orgánica se realiza mediante la acción bacteriana anaeróbica, con ausencia total de oxígeno disuelto. En el proceso anaeróbico, considerado, en términos generales, la materia orgánica es licuada, gasificada, mineralizada y transformada en materia orgánica más estable.
Por lo tanto en este tipo de laguna, se generan gases tales como metano e hidrógeno sulfurado, que se desprenden al ambiente provocando problemas de olores malolientes, los que generan malestar en la zona.
Para solucionar el problema de la propagación de olores malolientes, se instalará una cubierta flotante, que consiste en la colocación de una membrana de polietileno de 1,5 mm de espesor que cubrirá toda la superficie de la laguna primaria de alta carga. En todo el perímetro de la cubierta, debiendo asegurarse la total estanqueidad de la misma para evitar el escape de gases.
En tanto, en todo el perímetro de la cubierta se instalará una cañería colectora de los gases que se generan en el proceso anaeróbico, debiendo conducir los mismos a un quemador (antorcha) que se ubicará en el lugar más alejado de las viviendas vecinas.